本教會於1959年4月13日，由嘉義東門教會分設為「博愛佈道所」，由原屬東門教會林歡邦長老捐獻「博愛托兒所」為教室禮拜堂，1959年7月中會派李錦屏傳道師到任牧會。
1961年4月20日舉行開設典禮，正式成立「博愛教會」為東門教會支會。同年8月李傳道師離任，由蔡麟傳道師接任。10月15日由東門母會移轉成人會員44名，小兒會員26名隸屬本會，並設立第一任長執，成立小會及長執會。
1962年3月29日由蔡麟傳道師主持聖殿興建奠基禮拜，同年12月20日由中會議長張信得牧師主持獻堂典禮；建堂費用約七十萬元，除會友奉獻約三萬元，不足款由林歡邦長老捐獻。
1963年8月1日升格為堂會。本會將進入不惑之年，在歷任傳教者熱心牧會，使教勢穩步成長，且於1988、1989年大力促成分設友愛教會，割愛近二十位會員轉屬該會，1991年重新整修禮拜堂內部。
1998年10月成立松年團契；
1999年10月成立社區兒童合唱團。
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台灣基督長老教會嘉義博愛教會
Chayi Phok-ai Taiwanese Presbyterian Church
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