一九四八年泰雅爾族宣教之父孫雅各牧師以旅遊佈道與醫療之方式在各地傳道，試圖以如此加速全族歸主，並鼓勵泰雅族人建堂以便有固定的禮拜堂聚會。孫雅各牧師與七星中會羅東長老教會陳耀宗牧師、高添旺牧師至寒溪部落宣教，並於一九五一年二月五日首先用茅草蓋的聚會場所開始聚會(當時位於寒溪河床上，現在的簡瑛暖姐妹住家）一九五七年，經歷了六年的信仰累積，本教會的教勢日漸成長，有許多慕道友開始信主，聚會人數日漸增多，由加拿大籍宣教士戈德恩牧師在當年六月十日幫助寒溪教會興建木造房屋的禮拜堂(如今舊教會的前身)，但於一九七一年那次颱風的肆虐與侵襲，禮拜堂倒塌了。
歷經一年的時間，在陳耀宗牧師與五福眼科陳五福醫師的協助下，又得到基督教芥菜種會的支持，終於在一九七二年將二十五坪的水泥房禮拜堂興建起來(現在的舊禮堂)，同時在該年陳五福醫師也奉獻蓋十五坪的牧師宿舍，提供當時前來牧會的牧者家庭來居住。
一九八六年七月二十日，聖靈降臨在本教會，這個日子對寒溪教會是一個非常重要且富有意義的日子。主的靈動工在本教會幾位姐妹的身上，透過廣冬梅執事、鄭澄美長老、韋勝美執事等，藉著不同的恩賜，如說
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台灣基督長老教會寒溪教會
Stacis Church
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